代谢组学

靶向代谢组

靶向代谢组学是按照代谢组学的原理和思路,只对有限的几个或几类与生物学事件相关的代谢物进行分析和研究的方法。通常在通过非靶向代谢组学发现差异代谢物之后,再利用靶向代谢组学进行进一步系统的确证。近年来新发展起来的糖组学、脂质组学等也属于靶向代谢组学的范畴。与非靶向代谢组学相比,靶向代谢组学在分析上更具有针对性,与非靶向代谢组学优势互补,是代谢组学的重要组成部分。

靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照,对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。通常采用的技术方案包括常规的液质联用(LC-MS)分析技术和选择性反应/多反应监测技术(MRM/ SRM)。常规分析法首先利用LC-MS的方法对待分析样本进行大规模代谢组分析,然后通过与相同分析条件下标准品的分析结果进行比对,实现对样本内目标代谢群的定性和定量分析。MRM/SRM技术是基于已知或假定的反应离子信息,有针对性地选择数据进行质谱信号采集,对符合规则的离子对进行信号记录,去除不符合规则离子信号的干扰。定量过程中,该技术首先筛选到目标代谢物特异性的母离子,然后选择性地对这些母离子进行碰撞诱导,去除其他离子的干扰,只对选定的特异MS/MS2离子进行质谱信号的采集,从而实现对目标代谢分子更为特异、灵敏、准确的分析。

测试清单
样品要求
样品重复

服务项目 物质名称 种类
氨基酸及其衍生物 常见氨基酸及支链氨基酸 40种左右
能量代谢途径 三羧酸循环、糖酵解、磷酸戊糖途径等代谢物 超过40种
神经递质类代谢途径 包括生物原胺类神经递质:儿茶酚胺、多巴胺(DA)、去甲肾上腺素(NE)、5-羟色胺(5-HT,也称血清素)。氨基酸类神经递质包括:γ-氨基丁酸(GABA)、甘氨酸、谷氨酸、组胺、乙酰胆碱(ACh)。 约70种
酯酰肉碱类代谢途径 包括肉碱和酰酯肉碱 30种以上
脂肪酸代谢途径 C2-C24的短链脂肪酸和长链脂肪酸 40种左右
黄酮类物质 大豆异黄酮和黄酮 60种以上
胆汁酸代谢途径 包括CA、CDCA、DCA、LCA和HCA等 60种以上
植物激素类 褪黑素、脱落酸、赤霉素、茉莉酸等 超过10种
动物激素类 睾酮、雌酮、雌二酮和孕酮等 10种
维生素类 维生素A、D、E 7种
有机酸类 苹果酸、草酸、水杨酸、咖啡酸等 4种
尿液 >0.3ml 5000×g 4°C 离心30-60min,取上清, -80°C保存。
血清/血浆 >0.3ml 收集好的血清/血浆液氮速冻,-80°C保存。
脑脊液、羊水、胆汁等体液 >0.3ml 1000g-2000g 4°C 离心10min,(或使用0.22μm滤膜过滤),取上清,-80°C保存。
悬浮细胞 >107 离心收集细胞后液氮速冻后-80℃保存。
贴壁细胞 >107 培养好的贴壁细胞保存在1.5ml离心管中,液氮速冻后-80℃保存
细胞上清液 >10ml 1000g 4℃条件下离心3分钟,取上清,-80°C保存

 

动物样本(各种组织、血浆)  每组 ≥ 6个重复

植物、微生物样本(叶片、根组织)每组 ≥ 3个重复

细胞样本  每组 ≥ 3个重复

临床样本(血清、尿液、各种组织等) 每组 ≥ 10例

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