代谢组学

mGWAS是什么?mGWAS详细介绍

mGWAS (metabolome Genome-Wide Association Study)是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种领先方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细,因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高,通过代谢组与基因组整合的mGWAS分析,可以得到精准的代谢物的调控基因信息。

mGWAS的研究思路:

mGWAS(metabolome-based genome-wide association studies)的研究方法和GWAS类似,只是将代谢物含量作为表型性状来与基因位点进行关联。但同时它也有自己独特的优势,首先,因为表型测定是比较复杂的,尤其是数量性状表型,极易受环境影响,人为测量可能会有偏差,表型本身变化也会不稳定。代谢物的含量测定相对而言更加稳定和单一,这为我们数据分析减少了难度,代谢物相当于充当了中间桥梁。

第二,在研究的内容上会比GWAS更加丰富,代谢物测定本身是一种生理生化指标,在以往的研究中可作为反向遗传学研究手段,因此GWAS的正向遗传学研究和代谢组反向研究相结合,除了解析基因控制位点,还可进行代谢物调控机理机制研究。

一般研究思路:自然群体若有分群,做代谢物差异,mGWAS寻找位点,重点关注控制差异代谢物的位点,基因克隆,找到变异调控代谢物的机理;位点比较,进行演化和群体遗传研究;然后再研究代谢物如何影响表型变化(如通路水平)。





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