蛋白质组学

Label free-蛋白质定量组学

蛋白质非标记定量技术(label-free)是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。

技术流程

Label free技术流程

无需同位素标签做内部标准,实验耗费低。

对样本的操作少,从而使其接近原始状态。

不受样品条件的限制,克服了标记定量技术在对多个样本进行定量方面的缺陷。

对实验操作稳定性、重复性要求高,要求至少做三次技术重复或生物重复。

同位素标记和非标记定量的比较

同位素标记非标记定量样本标记同位素样本非标记在大样本过程中,难于追踪蛋白丰度易跟踪蛋白丰度低丰度蛋白识别有限能够鉴别低丰度蛋白需提前进行二级质谱蛋白鉴定可以鉴定差异后再进行二级质谱蛋白鉴定实验重复性高实验重复性低

技术平台

Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion™ Tribrid™

应用领域:

机理和调控机制研究

动态过程中机制研究

疾病标志物的筛选

用药及预后标志物筛选

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