蛋白质组学

蛋白质组学定向分析技术(MRM/SRM)的特点?


与我们熟悉的鸟枪法技术shot-gun有所区别,质谱蛋白质组学定向分析技术(targeted proteomics analysis by mass spectrometry)能够非常灵敏的检测到蛋白质信号,而且实验重复性也非常高。相比较之下,鸟枪法是将从一个蛋白质组样品里检出的所有质谱信号与现有的蛋白质数据库进行比对,从而对这些信号进行解析。

定向蛋白质组学技术则是利用质谱仪对一组经过预筛选的蛋白质样品进行分析。这种预筛选过程是通过选择反应监控技术(selected reaction monitoring,SRM,该技术又被称作多反映监控技术,multiple reaction monitoring,MRM)实现的。这种监控技术主要是为三重四级杆质谱仪(triple quadrupole instrument)开发的,专门用来探测可以代表每一个蛋白质的单一特征肽段产生的碎片离子信号(fragment-ion signals)。

SRM 技术具有极高的敏感度、定量精确度和可重复性。与目前仍占主导地位的鸟枪法蛋白质组学技术相比,使用了SRM的蛋白质探测技术速度更快,更直接。虽然 SRM技术的敏感性还及不上免疫检测技术,但是SRM技术在多路探测方面(multiplexed detection)具有明显的优势。

随着各种SRM实验技术不断成熟,该技术也将被更多的生物研究领域所采用。有很多科学家都非常看好SRM技术在发现生物标志物和系统生物学研究领域里的潜力。最近又有人利用SRM技术对计算机预测出的 线虫microRNA作用靶标蛋白进行了验证工作(Nat.Methods 7, 837–842; 2010)。

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