蛋白质组学

凝胶层析法测定蛋白质相对分子质量

实验目的

掌握凝胶层析的基本原理。

学习利用凝胶层析法测定蛋白质相对分子质量 的实验技能。

实验原理

凝胶层析法也称分子筛层析法,是利用具有一定孔径大小的多孔凝胶作固定相的层析技术。当混合物随流动相经过凝胶层析柱 时,其中各组分按其分子大小不同而被分离的技术。该法设备简单、操作方便、重复性好、样品回收率高。

凝胶是一种不带电的具有三维空间的多孔网状结构、呈珠状颗粒的物质,每个颗粒的细微结构及筛孔的直径均匀一致,像筛子,小的分子可以进入凝胶网孔,而大的分子则排阻于颗粒之外。当含有分子大小不一的蛋白质混合物样品加到用此类凝胶颗粒装填而成的层析柱上时,这些物质即随洗脱液的流动而发生移动。

大分子物质沿凝胶颗粒间隙随洗脱液移动,流程短,移动速率快,先被洗出层析柱;而小分子 物质可通过凝胶网孔进入颗粒内部,然后再扩散出来,故流程长,移动速度慢,最后被洗出层析柱,从而使样品中不同大小的分子彼此获得分离。

若分子大小介于上述完全排阻或完全渗入凝胶的物质,则居二者之间从柱中流出。总之,各种不同相对分子质量的蛋白质分子,最终由于它们被排阻和扩散的程度不同,在凝胶柱中所经过的路程和时间也不同,从而彼此可以分离开来。

如果假定蛋白质分子近于球形,同时没有显著的水合作用,则不同大小分子量的蛋白质,在洗脱时峰的位置和该物质相对分子质量有直接的定量的关系。在一根凝胶柱中,凝胶颗粒间空隙所含水相体积为外水体积VO,不能进入凝胶孔径的那些大分子,当洗脱体积为时VO,出现洗脱峰。

凝胶颗粒内部孔穴的总体积为内水体积Vi,能全部渗入凝胶的那些小分子,当洗脱体积为VO+Vi时,出现洗脱峰。

利用Andrews的实验经验式:

lgMr = a/b—Ve/bVo

式中,Ve为洗脱体积。它是自加样品开始到该组分的洗脱峰(峰顶)出现时所流出的体积。Vo为外水体积,Mr为相对分子质量,a和b为常数。
葡聚糖凝胶有不同的型号,用于分离不同相对分子质量大小的物质。例如Sephardex G-75的分级范围是3000-80000的球形分子。在本实验中用于分离胰岛素(Mr为6000)和牛血清蛋白(Mr75000)。

仪器和试剂

仪器:层析柱、恒流泵、紫外检测仪、自动部分收集器

试剂

待测样品:胰岛素、牛血清白蛋白

蓝色葡聚糖2000;Sephardex G-75;洗脱剂

实验步骤

1.凝胶溶胀

凝胶颗粒要求大小比较均匀 ,可流速稳定,结果较好。

取葡聚糖Sephardex G-75干粉,加过量的蒸馏水室温充分溶胀一天(溶胀时间因凝胶交联度不同而不同),或沸水浴中溶胀3小时,这样可大大缩短溶胀时间,而且可以杀死细菌和霉菌,并可排出凝胶内气泡。

溶胀过程中注意不要过分搅拌,以防颗粒破碎。待溶胀平衡后用倾泻法除去不易沉下的细小颗粒,最后凝胶经减压抽气除去气泡,即可准备装柱。

2. 装柱与平衡

装柱前须将凝胶上面过多的溶液倾出,将层析柱垂直装好。关闭出口,向柱管内加入约1/3柱容积的洗脱液,然后在搅拌下,将浓浆状的凝胶连续地倾入柱中,使之自然沉降,待凝胶沉降约2—3cm后,打开柱的出口,调节合适的流速,使凝胶继续沉集,待沉集的胶面上升到离柱的顶端约5cm处时停止装柱,关闭出水口。装柱要求连续、均匀、无气泡、无“纹路”。

将洗脱剂与恒流泵相连,恒流泵出口端与层析柱相连。通过2—3倍柱床容积的洗脱液使柱床平衡,然后在凝胶表面上放一片滤纸或尼龙滤布,以防将来在加样时凝胶被冲起,并始终保持凝胶上端有一段液体。

3. 上样与洗脱

样品上柱是实验成败的关键之一,若样品稀释或上柱不均,会使区带扩散,影响层析效果。上样时应尽量保持床面的稳定。

先打开柱的出口,待柱中洗脱液流至距床表面1~2mm时,关闭出口,用滴管将1ml样品慢慢地加至柱床表面,应避免将床面凝胶冲起,打开出口并开始计算流出体积,当样品滲入床中接近床表面1mm时关闭出口。

按加样操作,用少量(约1ml)洗脱液冲洗管壁2次。最后加入少量洗脱液于凝胶上,使高出床表面3~5cm,旋紧上口螺丝帽,柱进水口连通恒流泵,调好流速,以每管3ml/10min流速开始洗脱。上样的体积,分析用量为柱床容积的1—2%;制备用量为柱床容积的20%~30%。

4. 收集与鉴定

用自动部分收集器收集流出液,每管4ml,紫外检测仪280nm波长处检测,最高的一个OD值时的体积即为吸收峰的洗脱体积Ve。

5.凝胶柱的处理

凝胶用过后,反复用蒸馏水洗后保存,如果有颜色或比较脏,可用0.5mol/LNaCl洗涤。短期可保存在水相中,加入防腐剂或加热灭菌后于低温保存。建议长期用干燥状态保存。

计算

分子量的测定和计算,一般都采用标准曲线法。只要测得几种标准蛋白质相对分子质量的Ve,并以它们的相对分子质量的对数(logMr)对Ve作图得一直线,再测出待测样品的Ve,即可从图中确定它的相对分子质量

注意事项

各接头不能漏气,连续用的小乳胶管不要有破损,否则造成漏气、漏液。注意恒压瓶内的排气管应无液体,并随着柱下口溶液的流出不断有气泡产生,则表示恒压瓶不漏气。操作过程中,层析柱内液面不断下降,则表示整个系统有漏气之处,应仔细检查并加以纠正。

始终保持柱内液面高于凝胶表面,否则水分挥发,凝胶变干。也要防止液体流干,使凝胶混入大量气泡,影响液体在柱内的流动,导致分离效果变坏,不得不重新装柱。

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