蛋白质组学

SILAC定量蛋白质组学

 

SILAC标记定量

SILAC技术是由美国Thermo Fisher公司研发的一种多肽体内标记技术。该技术是将重型和轻型13C或15N同位素分别标记在L-赖氨酸和L-精氨酸两种必需氨基酸上。细胞经必需氨基酸培养5-6代后,所有蛋白质均会被标记上同位素。将不同处理因素刺激后的细胞蛋白进行质谱分析,在一级谱图中根据同位素峰型的面积大小进行丰度比对,二级谱图行肽段序列鉴定,即可得到蛋白质组的定性和定量数据。

 

凭借体内标记的优势, SILAC标记更好地保留了蛋白质的各种生物学特性,而且标记效果没有偏性。因此,该技术在涉及到蛋白质修饰、蛋白质与蛋白质相互作用、蛋白质与DNA/RNA相互作用等研究中的应用尤为广泛。

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主要仪器设备

 

Q Exactive™ Plus 组合型四极杆 Orbitrap™ 质谱仪

分辨率:140000 at m/z 200,可选 280000 at m/z 200
扫描速率:最高12 HZ
质量数范围:m/z 50- 6000
应用范围:高通量蛋白质鉴定——复杂样品
定量蛋白质组学——iTRAQ/TMT定量
修饰蛋白组分析

 

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‍样品要求

 

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应用方向

◇ 发病机理研究

◇  药物靶点研究

◇   蛋白质修饰研究
◇   蛋白质与分子互作研究
◇  特殊功能蛋白质筛选

客户代表文章

 

Chen XJ, et al. Homoharringtonine deregulates transcriptional expression by directly binding NF-κB repressing factor. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Feb 5;116(6):2220-2225.(IF=9.504,上海交大医学院附属瑞金医院)

Li R, et al. Expressway to Rheumatoid Arthritis by Macrophage-derived Microvesicle-Coated Nanoparticles. Nano Lett., 2018. (IF=12.08,复旦大学)

Huang H, et al. Kisspeptin/GPR54 signaling restricts antiviral innate immune response through regulating calcineurin phosphatase activity. Science Advances, 2018, 4(8): eaas9784. (IF=11.5,华东师范大学)

Yang L,  et al. Lectin Microarray Combined with Mass Spectrometry Identifies Haptoglobin-Related Protein (HPR) as a Potential Serologic Biomarker for Separating Nonbacterial Pneumonia from Bacterial Pneumonia in Childhood. Proteomics Clin Appl, 2018, 12: e1800030.(IF=3.567,上海儿童医学中心)

Jiang P, et al. Quantitative proteomics analysis of differentially expressed proteins in ruptured and unruptured cerebral aneurysms by iTRAQ. Journal of Proteomics, 2018, 182. (IF=3.722,首都医科大学附属北京天坛医院)

Sun H M, et al. PALLD Regulates Phagocytosis by Enabling Timely Actin Polymerization and Depolymerization. J Immunol. 2017 Sep 1; 199(5): 1817-1826.  (IF=4.539,上海交大医学院附属瑞金医院)

You D, et al. Acetyl coenzyme A synthetase is acetylated on multiple lysine residues by a protein acetyltransferase with a single Gcn5-type N-acetyltransferase (GNAT) domain in Saccharopolyspora erythraea. J Bacteriol. 2014 Sep; 196(17): 3169-78. (IF=3.219,华东理工大学)

 

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