蛋白质组学

iTRAQ定量

iTRAQ/TMT是一种体外(in vitro)肽段标记试剂盒,与SILAC(stable isotope labeling by/with amino acids in cell culture)相比,iTRAQ/TMT标记的是蛋白质酶解后的肽段,标记完成后,利用MS/MS(MS2)测定iTRAQ/TMT的报告离子(reporter ion)的信号强度,实现对不同样本中的蛋白质表达水平的相对定量。iTRAQ/TMT定量能力与SILAC仍存一定差距,但可以实现高通量,能同时进行多达8-10组样品蛋白质组的定性与定量分析;且几乎兼容所有的来源的样品,实验周期较短。

注意:
1. iTRAQ/TMT至少要进行3次技术重复(technical replicate),共获得3批MS数据,才能进行定量统计分析;
2. 严谨的实验要求,要进行3次实验重复和3次技术重复(共9批MS数据);鉴于MS测试费用很昂贵,很多文献也就进行2-3次技术重复而已
3. 理论上,iTRAQ能同时分析8组样品,TMT能分析10组样品,但是随着样品数目的增加,定量信息丰度会逐级减少。
上海科技有限公司研发部团队有丰富的iTRAQ/TMT定量质谱分析经验,能为客户提供快速的精准的定量质谱分析结果,并按照客户客户课题设计需要进行个性化下游分析。

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