蛋白质组学

iTRAQ定量蛋白质组和2-DGE相比,有什么优势?比2-DGE效果更好么?

2-DGE是伴随着MALDI-TOF技术发展起来的蛋白质分离技术,理论上可以通过等电点(IEF)和分子量(SDS-PAGE)的差异将总蛋白质逐一分开,实际情况并不理想,因为低丰度蛋白无法染色成功而看不见,蛋白翻译后修饰后偏离理论位置等等,一张2-DGE能鉴定到的蛋白质总数最多~2000蛋白。而iTRAQ是伴随LC-MS/MS技术发展起来的蛋白质组定量技术,不用做双向电泳,同时可以克服2-DGE无法鉴定低丰度和修饰蛋白干扰的情况,一针即可鉴定~2000左右的蛋白(1.5hr),分组分后,依据不同物种的情况有所差异,一般来说细胞或组织样本iTRAQ定量可以获得4000~6000个定量蛋白。

iTRAQ的优势不仅仅在于定量蛋白质组的数量,还在于单次实验可以同时做4~8个样本,降低仪器的系统误差,保持高通量定量能力。一般的定量蛋白质组实验,iTRAQ优势远远大约2-DGE,属于两个时代的技术。

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