蛋白质组学

iTRAQ、SILAC和DIA等相比,更应该选择哪一种定量的方法呢?

目前常见的定量蛋白质组方法有iTRAQ、SILAC、label-free和DIA。其中最流行的是iTRAQ定量蛋白质组方法,该方法不依赖样本,可以做任意样本的总蛋白质的差异定量,而且定量准确,这个层次上label-free虽然也可以做任意样本,但是定量准确度难以保障。SILAC是仅仅适合细胞层次的蛋白质组定量,组织的定量需要摸索或者前人已经摸索的模式,中途测试新组织难度较大,极易失败,细胞层次的SILAC培养费用高昂,不适合做商业化。DIA是目标蛋白质组相关的定量模式,DIA可以完成数千种蛋白的定量,准确度极高,对于亚细胞结构、细菌、真菌、细胞分泌物等样本,DIA效果非常好。DIA本身对物种没有偏向性,也是目标蛋白定量的一种,定量结果准确,发文章更具有说服力。

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