基因组学

GapCloser

GapCloser

  gap填补工具   事实上,目前有很多工具能够直接使用测序reads,填补序列中N碱基空缺。 因此对于gap区域,我们可以首先拿N碱基连起来(具体多少数量的N,可以参照参考基因组来确定),然后再设法补洞。 &…
基因组中的字符都代表什么

基因组中的字符都代表什么

参考基因组里除了ACTGN以外,还会看到其他一些字符,看一下这些字符都代表什么? DNA: Nucleotide Code: Base: ---------------- ----- A.................Adenin…
聚合酶链式反应(PCR)

聚合酶链式反应(PCR)

定义     聚合酶链式反应,其英文Polymease Chain Reaction(PCR)是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,由高温变性、低温退火及适温延伸等几步反应组成一个周期,循环进行,使目的DNA得以迅速扩增,具有特异…
熊猫全基因组研究进展

熊猫全基因组研究进展

引言 二代测序技术的出现,使得便宜有效的得到物种的基因组成为可能,大熊猫由于其濒危的地位和特殊的竹子食性受到广泛的关注,科学家们一直致力于研究并试图解决大熊猫危机,寻找影响大熊猫特殊生活习性的特殊基因组成分,本篇综述旨在阐述近十年,…
高通量转录组学技术的 应用及研究进展

高通量转录组学技术的 应用及研究进展

Microarray,data factory/ generator  高密度、灵活定制、微量样品。  从一个实验室技术发展成一个基因组学研究所依赖的,快速产生海量数据的常规手 段,正在逐步走向临床诊断。    High Throu…
请教kaks分析

请教kaks分析

请教下各位老师,关于kaks分析的问题。我有50株菌,想看某个基因在这50株菌中是否正向选择。50株菌意味着有50条这个基因的序列,两两比较后就很多kaks的结果,有大于1也有小于1的,那我该如何判断这个基因是否在50株菌中被正向选…
基因编辑iPSCS敲除技术原理与潜在的治疗应用

基因编辑iPSCS敲除技术原理与潜在的治疗应用

诱导多能干细胞(iPS细胞),是一种从成年(成熟)细胞生成的未成熟细胞,已经恢复了分化为体内任何类型细胞的能力。诱导的多能干细胞(iPS细胞)不同于胚胎干细胞(ES细胞),后者形成胚胎的内部细胞团,但也是多能的和原代细胞类似,最终导…
植物 SSR引物数据库 NAR 发核酸研究

植物 SSR引物数据库 NAR 发核酸研究

中国农业科学院油料作物研究所芝麻与特色油料遗传育种创新团队在国际知名学术刊物《核酸研究(Nucleic Acids Research)》发布了植物微卫星DNA及其标记开发数据库PMDBase。该数据库的创建和共享将为全球作物功能基因…